Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms