Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SMG1Q96Q15 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SMG1Q96Q15 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms