Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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RTL8BQ17RB0 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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RTL8BQ17RB0 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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