Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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PDK4Q16654 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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PDK4Q16654 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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PDK4Q16654 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PDK4Q16654 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PDK4Q16654 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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PDK4Q16654 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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PDK4Q16654 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDK4Q16654 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDK4Q16654 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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