Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ZNF239Q16600 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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