Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPS72Q15906 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
VPS72Q15906 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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