Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KARSQ15046 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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