Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
SMC1AQ14683 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SMC1AQ14683 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms