| RUNX2 | Q13950 | C1orf141-205 | ENST00000475209 | 2079 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP361-201 | ENST00000362686 | 118 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.80-201 | ENST00000362996 | 102 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.485-201 | ENST00000384395 | 102 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-11-201 | ENST00000408051 | 138 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-9-201 | ENST00000408365 | 138 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-10-201 | ENST00000408734 | 138 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1001P-201 | ENST00000411265 | 100 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005534.2-201 | ENST00000431047 | 433 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00448-201 | ENST00000438352 | 402 nt | TSL 3 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009237.7-201 | ENST00000447357 | 229 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL163540.1-201 | ENST00000485382 | 386 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-44P-201 | ENST00000516795 | 194 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP137-201 | ENST00000516833 | 135 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002770.2-201 | ENST00000543613 | 532 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C18orf54-203 | ENST00000578138 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1302-2-201 | ENST00000607096 | 138 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006157.1-201 | ENST00000611750 | 366 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245884.12-201 | ENST00000615364 | 59 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL606534.2-204 | ENST00000635008 | 178 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC003984.1-201 | ENST00000450977 | 4104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CHORDC1-205 | ENST00000529726 | 4805 nt | TSL 2 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1301P-201 | ENST00000362724 | 104 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-708P-201 | ENST00000384217 | 107 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA67.2-201 | ENST00000384300 | 149 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR769767.1-201 | ENST00000436337 | 346 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EHHADH-202 | ENST00000440662 | 656 nt | TSL 3 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCB1-IT1-201 | ENST00000441231 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | APOA2-205 | ENST00000468465 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091179.3-201 | ENST00000474761 | 144 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.14-201 | ENST00000516481 | 132 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC144568.1-201 | ENST00000520139 | 137 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233702.2-202 | ENST00000562547 | 291 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5006-201 | ENST00000583027 | 110 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5188-201 | ENST00000583467 | 113 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4719-201 | ENST00000585233 | 84 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP20-201 | ENST00000604477 | 205 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC013412.1-201 | ENST00000610687 | 192 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U2.1-201 | ENST00000618978 | 145 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Clostridiales-1.2-201 | ENST00000636724 | 160 nt | BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIPOL1-203 | ENST00000537471 | 5954 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA67.4-201 | ENST00000384688 | 142 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR329-1-201 | ENST00000385028 | 80 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EDDM3CP-201 | ENST00000415977 | 425 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114482.1-201 | ENST00000418010 | 247 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS12P2-201 | ENST00000439728 | 269 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139109.1-201 | ENST00000455491 | 297 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC112492.4-201 | ENST00000456549 | 352 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026436.1-201 | ENST00000510537 | 270 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-911P-201 | ENST00000516523 | 104 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022868.1-201 | ENST00000517767 | 391 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093023.1-201 | ENST00000547375 | 507 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006600.1-201 | ENST00000572529 | 153 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MZT1P2-201 | ENST00000604387 | 248 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD14A-201 | ENST00000606526 | 91 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022202.1-201 | ENST00000613515 | 211 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005296.1-201 | ENST00000616145 | 209 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZEB2_AS1_1.1-201 | ENST00000621504 | 128 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018692.1-202 | ENST00000623559 | 676 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF271P-202 | ENST00000465539 | 1970 nt | BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.04 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 2.28 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CSNK1G3-202 | ENST00000360683 | 4047 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OXR1-215 | ENST00000531443 | 3599 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KNL1-204 | ENST00000527044 | 5404 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR21-201 | ENST00000362134 | 72 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-280P-201 | ENST00000364145 | 104 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-743P-201 | ENST00000364151 | 106 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.326-201 | ENST00000365176 | 113 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1011P-201 | ENST00000384668 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.645-201 | ENST00000391229 | 102 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.605-201 | ENST00000410577 | 105 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SRIP3-201 | ENST00000413200 | 219 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093382.1-201 | ENST00000413311 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL160004.2-201 | ENST00000432935 | 350 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRELID3BP1-201 | ENST00000457142 | 540 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS23P5-201 | ENST00000495419 | 428 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA4.4-201 | ENST00000515921 | 135 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-991P-201 | ENST00000516168 | 107 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU5F-4P-201 | ENST00000516581 | 114 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-344P-201 | ENST00000516635 | 111 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003072.1-201 | ENST00000531740 | 145 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL442163.3-201 | ENST00000554110 | 156 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VN1R91P-201 | ENST00000594377 | 169 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355512.1-202 | ENST00000607952 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL357075.2-201 | ENST00000614906 | 189 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016717.2-201 | ENST00000609089 | 5141 nt | BASIC | 2.27 | □□□□□ -2.05 | | |