Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EXOSC2Q13868 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EXOSC2Q13868 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms