Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ATRQ13535 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ATRQ13535 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ATRQ13535 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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