Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GPM6BQ13491 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GPM6BQ13491 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms