Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RIGQ13278 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RIGQ13278 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RIGQ13278 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RIGQ13278 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms