Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CALCOCO2Q13137 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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