Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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