Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ECH1Q13011 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ECH1Q13011 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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