Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CPSF1Q10570 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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