Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERFP50548 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERFP50548 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ERFP50548 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ERFP50548 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ERFP50548 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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