Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CENPFP49454 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CENPFP49454 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CENPFP49454 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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CENPFP49454 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
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CENPFP49454 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CENPFP49454 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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