Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CTIFO43310 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CTIFO43310 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CTIFO43310 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CTIFO43310 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CTIFO43310 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CTIFO43310 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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