Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP53Q70EK8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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