Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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