Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
LAMA3Q16787 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LAMA3Q16787 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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