Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
HIF1AQ16665 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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