Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZNF239Q16600 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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