Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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VAMP3Q15836 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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VAMP3Q15836 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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