Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDE1CQ14123 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms