Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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PDE6HQ13956 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PDE6HQ13956 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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