Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1Q13813 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1Q13813 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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