Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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PRPF4BQ13523 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PRPF4BQ13523 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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