Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SF3B2Q13435 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SF3B2Q13435 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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