Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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TCOF1Q13428 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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TCOF1Q13428 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
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TCOF1Q13428 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
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TCOF1Q13428 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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