Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NME3Q13232 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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