Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIN2BQ13224 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms