Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CALCOCO2Q13137 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CALCOCO2Q13137 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CALCOCO2Q13137 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CALCOCO2Q13137 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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