Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MRPL28Q13084 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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