Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms