Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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HOXC5Q00444 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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