Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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TTPAP49638 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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TTPAP49638 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TTPAP49638 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TTPAP49638 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TTPAP49638 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TTPAP49638 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TTPAP49638 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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