Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms