Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms