Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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USP53Q70EK8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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USP53Q70EK8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP53Q70EK8 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP53Q70EK8 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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