Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZBED9Q6R2W3 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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