Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
C9orf135Q5VTT2 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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