Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RTL8BQ17RB0 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RTL8BQ17RB0 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.8 ms