Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RTN1Q16799 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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