Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CLPPQ16740 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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