Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZNF239Q16600 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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