Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
VAMP3Q15836 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VAMP3Q15836 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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