Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms